Os humanos amarrados na Matrix estão obrigados pela escolha de aceitar o programa - o Matrix Reloaded explica isso durante o discurso do Arquiteto.
Isso não significa que o indivíduo precisa estar ciente do que realmente acontece com ele em todas as circunstâncias; significa apenas que eles aceitam quaisquer mudanças que a Matrix tente afetar.
Uma coisa comum que fazemos hoje com programas de computador de todos os tipos é separar os dados das coisas que mudam ou trabalham com os dados. Assim, no Matrix, os seres humanos podem ser considerados algo como um "modelo" - apenas um conjunto de dados com o qual o código Matrix pode trabalhar através de inúmeros controladores *. Esses controladores trabalham nos dados para afetá-lo, ou coisas ao redor dele. O "modelo" não precisa entender essas mudanças; eles apenas atualizam com novas estatísticas, como um videogame.
É por isso que um ser humano não precisa "entender" a física de ser baleado ou cair de um telhado para ser ferido. A Matriz atua nesse corpo, e como o indivíduo já aceitou o programa, eles nem sequer percebem que podem escolher simplesmente fugir ou rejeitar a bala. Considerando que um indivíduo que foi retirado, percebeu a verdade dentro de si, e talvez até mesmo se torne O Único, pode não apenas rejeitar os controladores que tentam agir sobre eles, mas exercitar sua própria vontade no lugar de um controlador para causar efeitos. por conta própria!
- edit - Eu não estou sugerindo que os humanos são simples e estúpidos dados - caso contrário, eles desmoronariam e morreriam no minuto em que fossem liberados. Eu só quero dizer que a Matrix pode modificá-los de maneira similar. Não é uma analogia perfeita, mas acho que vale a pena.