Os sistemas têm muito pouco a ver um com o outro. Ambos são jogos trad (ao contrário de indie) e ambos são impressos em papel. É isso aí. Você não vai portar nada baseado em crunch de um jogo para o outro (você pode criar gráficos e personagens, mas não as estatísticas).
Combate
O Pathfinder tem um complexo sistema de combate derivado de D & D / d20 com armaduras que evitam os impactos e pontos de vida que sobem com o nível; tudo tem uma escala acentuada com o nível e existe uma enorme disparidade entre PCs de alto e baixo nível. Apesar de salvar ou morrer, a letalidade geralmente diminui com o nível, porque você tem muitos pontos de vida.
Runequest tem um sistema de combate baseado em habilidade relacionado a BRP, com armaduras de dano e pontos de vida que não sobem de nível; a letalidade permanece, especialmente se for pego em desvantagem, à medida que os personagens progridem. Você nunca se torna um super-herói como você no nível 10 do Pathfinder.
Magia
O Pathfinder usa os tradicionais D & D "Vancian" para memorizar feitiços específicos e conjurar o sistema. Há arcano / divino que não difere tanto assim.
Runequest usa um sistema de pontos mágicos e tem espírito, divino, ritual e feitiçaria, todos diferentes.
Objetivos
O Runequest sempre será mais corajoso e, portanto, se adapta bem à investigação e à baixa fantasia. Muito combate te matará.
O Pathfinder sempre vai estar mais empolgado - existem variantes como o E6 (que nunca ultrapassam o 6º nível!) que tentam alcançar a mesma coisa, mas estão mais ligadas a um jogo de média e alta fantasia onde os heróis são baixos. super-heróis de grau. Você não tem que jogar como um jogo focado em combate (eu não), mas tem suporte para isso.