Não sei por que você acha que Hermione "nunca deixou escapar" que ela era nascida trouxa. Ela fala sobre isso livremente na primeira vez que a encontramos:
"Are you sure that's a real spell?" said the girl. "Well, it's not very good, is it? I've tried a few simple spells just for practice and it's all worked for me. Nobody in my family's magic at all, it was ever such a surprise when I got my letter, but I was ever so pleased, of course..."
— "Harry Potter and the Sorcerer's Stone", chapter 6, "The Journey from Platform Nine and Three-Quarters"
Malfoy não estava presente naquela época, mas se ela não visse nenhum motivo para não falar sobre seus pais, ele poderia facilmente tê-la mencionado a qualquer momento - talvez no mesmo dia no Expresso de Hogwarts enquanto ela andava por aí. tentando ajudar Neville a encontrar seu sapo.