Mace Windu se desculpou com Ahsoka Tano?

Não, ele não está se desculpando. Vamos dar uma olhada em sua citação no contexto.

Ki-Adi-Mundi: This is the true sign of a Jedi Knight.
Mace Windu: This was actually your great trial. Now we see that. We understand that the Force works in mysterious ways, and because of this trial, you have become a greater Jedi than you would have otherwise.
Yoda: Back into the Order you may come.
_{Star Wars: The Clone Wars - The Wrong Jedi}

O subtexto é que eles estavam errados em expulsá-la da Ordem, e eles fazem isso direito, deixando-a de volta. No entanto, o Conselho considerou sua provação em retrospectiva como sendo seus Trials e, tendo provado a si mesma pronto e digno , ofereceu-lhe a promoção para o Cavaleiro Jedi. Eles não estão se desculpando, ou oferecendo a posição por algum sentimento de culpa, ou até mesmo culpando a Força. Eles estão simplesmente reconhecendo que algo aconteceu, e que, como resultado, Ahsoka é um cavaleiro Jedi.

Seguindo suas palavras, e considerando o que entendemos sobre o universo de Guerra nas Estrelas, as palavras de Mace podem não ter sido uma tentativa de desviar a culpa, mas sim uma avaliação precisa da situação.

A Força tem vontade própria e funciona de maneira misteriosa. Por exemplo, podemos dizer que Anakin foi de fato o que trouxe equilíbrio para a Força, apesar do fato de que ele passou tantos anos trabalhando para Palpatine. A Força não organiza diretamente os eventos para chegar rapidamente à conclusão de que ela exige, mas guia as pessoas através de experiências (algumas boas e outras ruins). Em suma, parece haver uma alegoria sendo traçada entre a Força e o Deus Judaico-Cristão (o exemplo mais flagrante disso é "a Força opera de maneiras misteriosas"). A maior diferença entre esses dois conceitos é que, no universo de Star Wars, a existência da Força não é tão ferozmente debatida.

Com isso em mente, considere o fato de que tanto Mace quanto Ahsoka dedicaram suas vidas a serviço da vontade da Força. Eles entendem que os eventos em suas vidas são guiados pela Força, e que às vezes até mesmo suas ações são guiadas pela Força (considere o treinamento com o sabre de luz dos olhos de Lucas). Então, quando Mace diz que esta foi a grande prova de Ahsoka, ele pode não estar tentando desviar a culpa. Ele pode muito bem estar sinceramente parabenizando Ahsoka por aprovar o julgamento que a Força havia lhe dado.