Eu só posso oferecer informações (a partir de 2014) sobre a aldeia flutuante de Prek Toal, na foz do rio Sangkae (no Tonle Sap). Achei absolutamente fascinante ver como essas pessoas vivem em casas flutuantes e até criam animais e pequenos jardins flutuando na água. O turismo não parece ser um grande fator ainda. Tenho certeza de que as crianças adorariam isso.
Existe uma conexão de barco entre Siem Reap e Battambang, que passa por Prek Toal e é uma experiência impressionante. Mas também é muito longo, quente e lotado, e será pior em fevereiro, quando o nível da água é menor. Eu não posso recomendá-lo naquele momento ou com crianças pequenas. Caso contrário, você poderia ter-se apanhados em Prek Toal depois de receber uma visita guiada lá e talvez passar a noite (depende de como os tempos se alinham).
Pelo que eu ouvi, a transferência de barco entre Siem Reap e Phnom Penh é otimizada para velocidade, não para turismo, mas não tenho certeza. Talvez haja um que pare em uma aldeia flutuante onde você poderia fazer a mesma combinação descrita acima.