No seu caso, você não precisa limpar a imigração no KLIA2. Já fiz isso várias vezes, não para a Índia, mas para outros países onde não preciso de visto. Se o seu cartão de embarque KUL-HYD não precisar do Document Check, então você está pronto para ir. Apenas siga a direção do trânsito, desmarque a segurança e vá até o portão de embarque. Espero que esta ajuda.