Você não precisa obter um FMM antes de reservar os ingressos. Se você estiver voando, não precisa visitar o site.
O procedimento atual é que você receberá o formulário FMM durante o voo para preencher antes de aterrar no México. Você pagará a taxa à companhia aérea como parte do preço do seu bilhete (código IATA UK no recibo do bilhete). Você mostra o FMM na imigração quando entra no México, guarda-o e entrega-o quando faz o check-in para o seu voo que sai do México.
Você também pode comprar o FMM antecipadamente no site gob.mx, como você descobriu. Nesse caso, você já terá pago por isso. O site fornecerá o FMM que você deve imprimir, mostrar à imigração e entregar quando sair do México. Se você estiver voando, não deve fazer isso, pois já pagou a taxa de FMM pela companhia aérea. É recomendável comprar o FMM com antecedência quando você entra no México por estrada, pois pode ser difícil obtê-lo em algumas passagens de fronteira.
(Os cidadãos e residentes mexicanos não devem cobrar a taxa de FMM (código IATA UK) ou o imposto de partida (código IATA XD). Se você é cidadão ou residente mexicano e foi cobrado, sua companhia aérea pode emitir um reembolso.)