A temperatura terá sido alta o suficiente para ser segura, então não se preocupe.
O que você vai conseguir é um estoque mais escuro e saboroso. Não é adequado para tudo (é provável que seja nublado, bem como escuro), mas pode ser muito bom. Quando eu comecei meu novo fogão lento, tendia a fazer isso, porque ele fica um pouco mais quente do que o meu antigo. Corrê-lo em baixa em vez de alta (começando com o líquido fervente) resolveu isso.
Você também pode usar o estoque concentrado que você fez, lembre-se de usar muito menos do que você faria com o estoque normal.