people said I cannot go back the US without US passport,
Isso não está correto. Por um lado, você deve ter um passaporte, mas não há nenhuma penalidade por quebrar essa regra e, mais importante, cidadãos norte-americanos não podem ser impedidos de entrar nos EUA se forem fornecidas provas adequadas de que são de fato cidadãos. Não há regra dura e rápida aqui, mas o próprio USCIS diz
You will receive your Certificate of Naturalization after taking the Oath of Allegiance. You may use your Certificate of Naturalization as official proof that you are a U.S. citizen.
Então, os agentes de fronteira devem aceitar isso. Eu não acho que seria tão bom quanto entrar com um passaporte, mas deveria funcionar. Note que a companhia aérea pode lhe dar um tempo difícil de embarque. Consulte o link desta resposta.
thus can I apply the US passport in Hong Kong?
Sim. link O Certificado de Naturalização dos EUA é mencionado novamente.