Acho que Varys deixa perfeitamente claro que o requerente do Trono de Ferro que ele apoia é Aegon. Então, logo de cara, tenho dificuldade em entender por que Varys gostaria que Sor Barristan fosse até Dany em vez dele. Ilyrio e Varys apenas apoiam Dany na medida em que ela pode ajudar a reivindicação de Aegon.
O próprio Sor Barristan conta a Daenerys o que aconteceu depois que ele deixou o serviço de Joffrey. Ele ficou em King's Landing por um mês disfarçado de camponês, até testemunhar a execução de Eddard Stark. Naquele momento, ele começou a questionar seus anos de serviço ao Usurper, e percebe que a única maneira de fazer penitência é encontrar a filha de Aerys e prometer seu serviço. Ele nunca diz como terminou com Ilyrio, mas nas reuniões do Pequeno Conselho saberia que Ilyrio e os irmãos Targeryen eram próximos.
Todas as indicações de Sor Barristan são que ele realmente desejava procurar Dany e protegê-la. Ele poderia estar mentindo, suponho, mas não percebemos isso em seus capítulos sobre pontos de vista e isso seria contrário ao seu personagem. Portanto, se Varys pretendia que Sor Barristan fosse procurá-la, foi um palpite de muita sorte da parte dele.
Enquanto isso, vejo muitas razões pelas quais Varys não quer Barristan com Dany. Sor Barristan tem uma visão muito negativa de Varys, e considera Ser Jorah um dos espiões da Aranha. Ele também pode confirmar que Varys foi quem enviou a ordem de Robert para matá-la e até votou em sua morte.
Eu acho que é muito mais provável que Varys só queira enfraquecer Joffrey enviando um recurso importante. O fato de que Ser. Barristan acabou com Daenerys em vez de Renly ou Stannis provavelmente foi apenas uma feliz coincidência.