A melhor explicação é a primeira. Walt ainda não quer admitir que ele constitui um perigo para a família (incluindo seu incomodo na lei Hank). E ele certamente não quer assustar Skyler. Por mais que Walt queira deixar Skyler saber que ele fez algo para proteger a família, ele não pode fazer isso sem revelar as profundezas para as quais ele já passou e o perigo que ele expôs a eles.
A única maneira pela qual a segunda explicação, mais complicada, poderia ser verdadeira seria se Skyler já soubesse todos os detalhes das atividades de Walt e o considerasse capaz de manipular os níveis de maquiavélicos. Eu não acho que ela consegue isso até algum momento da 4ª temporada.