Você pode certamente envernizar uma seção ou um local. Muito melhor do que deixá-lo nu, se estiver, onde ficará mais difícil de consertar enquanto você espera - mesmo que não corresponda.
Torná-lo misturar é mais problemático, embora parte disso possa ser ajudada por "apenas usá-lo", em vez de se preocupar com isso quando for refeita novamente e o resto do piso não for - será muito menos perceptível após um mês de desgaste , na maioria dos casos.
Como você menciona "cores", estou um pouco preocupado que você esteja lidando não apenas com verniz (que pode variar de transparente à água a várias cores amarelo-âmbar, dependendo da formulação), mas com manchas, o que é muito mais difícil de combinar.