As instruções estão, de fato, pedindo para você colocar uma tigela de água no Forno de Microondas e executá-lo por 10 minutos.
A razão é que permite que as coisas "invadam" e assegura que você não tem problemas diretos com o dispositivo e que todos os solventes desagradáveis recebem tempo adequado para "queimar". Isso é para que você não acabe com cheiros e sabores desagradáveis de plástico na sua primeira refeição.
Por razões de segurança, eu recomendaria colocar uma colher de pau na tigela. Isso fornece muitos locais de nucleação e impedirá o "superaquecimento" da água.
Sempre use recipientes adequados para microondas e deixe a tigela ficar razoavelmente (quente à temperatura ambiente) antes do manuseio.