Eu assumiria que is possível transportar uma extremidade do buraco de minhoca através de um buraco de minhoca, se a extremidade do buraco de minhoca tiver um estado "desativado", no qual não há conexão de hiperespaço presente.
Seria necessário assumir que a extremidade do buraco de minhoca é transportada nesse estado desativado, movida para um local apropriado (por exemplo, sem gradiente de gravidade) e depois "ligada". Enquanto estiver em seu estado desativado, pode ser apenas mais um pedaço de maquinaria sem requisitos especiais e, portanto, pode ser transportado por um buraco de minhoca.
No entanto, pode haver algum tipo de pré-conexão (suficiente para manter a conexão entre os pontos A e B, mas não grande o suficiente para que algo possa viajar) através do hiperespaço que é mantido durante a viagem. E se esta Nesse caso, provavelmente não seria possível enviar o portal através de um buraco de minhoca.
O argumento do @Richard sobre vários buracos de minhoca entre sistemas, para se recuperar mais facilmente da destruição do portal, faria muito sentido de qualquer maneira, assim como um grande grau de redundância, por exemplo, cinco buracos de minhoca por sistema. A única razão possível para eu pensar por que esse não seria o caso (se "portais através do buraco de minhoca" é possível ou não) seria que a criação e o transporte do buraco de minhoca são tão fabulosamente caros que o Mercatoria não pode dar ao luxo de fazê-lo.