Entendo que, se um piloto está sobrevoando um oceano ou outro espaço aéreo não controlado e encontra um cumulonimbus, ele o navega a seu critério.
Como isso acontece no espaço aéreo controlado? Quais instruções o ATC e um PIC geralmente trocam se um PIC deseja solicitar navegação em uma trovoada?
Se você estiver em um espaço aéreo controlado, seu ATC muito possível o direcionará ao clima, você pode descobrir mais sobre isso nesta questão.
No entanto, o que o ATC pode ver em seu escopo varia de um lugar para outro e o clima se move rapidamente. Como tal, os pilotos podem, e geralmente solicitam, desvios do tempo. Digamos que você esteja voando desviando de algumas nuvens aqui e ali, entrando e saindo, e de repente você sai com uma célula se formando à sua frente. Você pode solicitar algo como:
N123AB requesting left turn 20 degrees for weather
N123AB left 20 approved for weather avoidance
Também pode não ser uma má idéia registrar um PIREP para ajudar os outros.
Por fim, como piloto em comando, você pode se desviar de qualquer regra para garantir um voo seguro. Se você estivesse prestes a voar direto através de uma tempestade e o ATC não estivesse permitindo um desvio ou não emitindo um, um caso poderia ser feito por se desviar de qualquer maneira. Você pode ler mais sobre isso aqui.