Fiz algumas pesquisas depois da resposta de @niels nielsen; o mecanismo que está sendo usado no MQ-9 é o Honeywell TPE331-10. Como Niels apontou corretamente, o motor turboélice tem sua entrada voltada para a traseira e o escapamento da turbina está voltado para frente (acredito que isso seja conhecido como fluxo reverso).
Captura de tela do vídeo do Youtube abaixo. A imagem da esquerda mostra a seção traseira em esbranquiçado (as flanges douradas estão no eixo de transmissão do suporte), com a entrada abaixo. A imagem à direita mostra o escapamento da turbina, voltado para a frente. 
Agora a responda a questão: deduzindo disso Alamy - foto de acervo, o separador da concha principal desvia o fluxo de ar em dois canais para a entrada do motor principal (as duas tampas vermelhas em forma de rim). O duto NACA ao longo da linha central é para um refrigerador separado (a abertura retangular).
Fotos adicionais também mostram como o ar é direcionado ao redor do motor. o imagem esquerda mostra um duto que provavelmente vem do canal aéreo do porto, conectado a um plenum (?). o imagem certa mostra uma visão interna mais clara, sem o duto. As saídas do duto estão circuladas em amarelo. Eu acho que isso é o mesmo no lado de estibordo. 
A partir das informações que pude encontrar, este é meu palpite sobre como é feito o duto interno. Por favor, desculpe o grosseiramente anotado imagem de tela: 
