Há informações úteis sobre isso em todos os lugares no site da ferrovia.
https://www.italiarail.com/flood-warnings-venice
Basicamente, a questão é que, como eles dizem
It happens when an unusually high tide pushes water from the Adriatic Sea into the Lagoon helped by southern winds and low atmospheric pressure. The flooding isn’t dangerous and it’s not considered a big deal, as the water usually subsides within a few hours. In the past century it has become more frequent, and now it can happen any time of year.
Portanto, você pode evitar momentos de lua cheia ou nova, quando as marés da primavera ocorrem, caso contrário, parece que você apenas sorri e aguenta.