O mais próximo que temos são algumas citações de Infinity War: Vision descreve a Pedra da Mente até certo ponto:

Vision: No, we have to destroy it. I've been giving a good deal of thought to this entity in my head, about its nature. But also, its composition. I think if it were exposed to a sufficiently powerful energy source, something, very similar to its own signature, perhaps… Its molecular integrity could fail.

Mais tarde, quando o Vision é levado para Wakanda, e Shuri examina a pedra em busca de uma possível remoção:

[In Shuri's lab, Shuri scans the Stone with her kimoyo beads while Vision lies on the examination table. She flips her hand over and studies the hologram projected over her palm]

Shuri: Whoa. The structure is polymorphic.

Embora essas duas instâncias não nos digam exatamente do que as pedras são feitas, é seguro dizer que elas são realmente feitas de matéria regular "polimórfica", composta de moléculas de algum tipo.

Nós não sabemos

In Guardiões da Galáxia O colecionador apenas afirma que são singularidades que foram forjadas em lingotes concentrados. O que quer que isso signifique.

The Collector: Oh, my new friends. Before creation itself, there were six singularities. Then the universe exploded into existence, and the remnants of these systems were forged into concentrated ingots. Infinity Stones. These stones, it seems, can only be brandished by beings of extraordinary strength.

_{Guardians of the Galaxy}

No entanto, em Avengers: Infinity War Wong afirma que eles são cristais elementares.

Wong: From the dawn of the universe, there was nothing. Then, boom! The Big Bang sent six elemental crystals, hurtling across the virgin universe. These Infinity Stones each control an essential aspect of existence.

Doctor Strange: Space. Reality. Power. Soul. Mind. And Time.

_{Avengers: Infinity War}

Trata-se de tanta informação que temos sobre o que são, para que não possamos realmente obter informações sobre o que são feitos.

As pedras são feitas de átomos.

In Endgame, temos esse diálogo

STEVE ROGERS : Where are they?
...

THANOS : The universe required correction. After that, the stones served no purpose, beyond temptation.
...

NATASHA ROMANONFF : Where are the stones?

THANOS : Gone. Reduced to atoms.
...

THANOS : I used the stones to destroy the stones. It nearly... killed me. But the work is done. it always will be. I am inevitable.

Estou bastante certo de que isso serve para contornar a inevitável questão de saber se faz sentido que a Pedra seja poderosa o suficiente para se destruir: elas não foram destruídas. Eles foram dispersos apenas a ponto de não poderem ser remontados e nunca mais serem usados ​​novamente.

De qualquer forma - aí está. Eles são feitos de matéria atômica normal.

Nos quadrinhos Thanos Quest #2, aprendemos que o colecionador submeteu sua gema (a pedra da realidade) a um considerável estudo científico. Embora ele não tenha conseguido detectar o poder subjacente que a pedra representa, ele foi capaz de verificar de que material é composto. Nada mais que "um pedaço inútil de vidro polido".