Há várias razões para isso:
Nem todo mundo usa o balcão de check-in
Nem todos os passageiros usam o balcão de check-in. Atualmente, com as companhias aéreas cobrando mais dinheiro para despachar bagagem, mais passageiros apenas carregam bagagem de mão. Isso significa que eles não passam no balcão de check-in, mas vão direto para a segurança. Portanto, é necessária uma verificação no portão.
A verificação no portão é um gargalo
Como mencionado nos comentários:
Also, the boarding check is a bottleneck. If at all possible, the airline would rather catch problems at check-in.
Isto também é verdade. Se o passageiro for pego no check-in, isso causará menos interrupções para a companhia aérea e outros passageiros posteriormente.
Evitando interrupções mais tarde
Se um passageiro for recusado a embarcar, sua bagagem deverá ser removida e o voo poderá ser atrasado por um período considerável de tempo.
Voos atrasados custam bilhões à companhia aérea a cada ano. A companhia aérea não quer custos extras. Antes de tudo, nem todos usam o balcão de check-in. Alguns carregam apenas bagagem de mão e seguem direto para a segurança e para o portão de embarque.
Sem erros
As verificações também são feitas duas vezes para garantir que não haja erros, pois esse erro pode causar muitos problemas à companhia aérea. Algumas pessoas também poderiam ter esquecido o balcão de check-in. É como perguntar por que a equipe da companhia aérea verifica seu cartão de embarque no portão e no avião, para garantir que você não esteja no voo errado!
Aceitou no balcão de check-in, mas recusou-se no portão?
Isso pode ocorrer porque as verificações não foram feitas corretamente ou no portão algo surgiu no sistema das companhias aéreas.