Aquela cidade estava em Wakanda?

Acho que não.

O local da filmagem é Joanesburgo. Desmond Mthembu é o chefe da comissão de filmes na província local de Gauteng e contou a Jornal local:

“The great thing about this movie is that they are shooting Johannesburg as Johannesburg. Often you will find filmmakers will shoot in Johannesburg and portray the location as Los Angeles. This time around the first 10 minutes of the film will be of Johannesburg.”

Eu não sei se realmente vemos isso na tela, mas não vejo razão para que ele tenha dito isso à Marvel se não fosse realmente o caso.

Algumas considerações adicionais:

• Nos quadrinhos, Wakanda é escondido do mundo exterior. No capacete do Homem de Ferro, quando ele procura notícias, ele vê tweets e imagens da CNN. E depois Maria diz: “As notícias estão amando vocês”. Não está de acordo com todo o elemento de sigilo.
• Sabemos que Ulysses Klaw roubou quantidades significativas de Vibranium dos Wakandans e foi considerado ladrão de acordo. Se essa cidade fosse Wakandan, ele estaria na porta deles. Eu acho improvável que ele fique lá por muito tempo, se puder.
• Acrescentando peso à ideia de que este é o universo de Joanesburgo, um superficial pesquisa de imagens para "Johannesburg police" mostra pessoas vestidas com uniforme idêntico ao do filme.