A resposta simples é ativar o ventilador em vez de automático. Isso ajudará a uniformizar a temperatura durante os ciclos de desligamento. Usando os amortecedores no sistema de dutos, feche o amortecedor do apartamento com o termostato 50% e faça os ajustes necessários em todos os outros apartamentos. Faça anotações sobre como os amortecedores são definidos, pois provavelmente será uma mudança sazonal que deve ser feita ao passar do aquecimento para o resfriamento.
Adicionar um termostato multissensor como um ecobee, como mencionado nos comentários, também ajudará. Mas isso não eliminará o problema. Você precisa equilibrar o fluxo de ar em cada apartamento. Se os apartamentos que normalmente são frios são repentinamente confortáveis, então os confortáveis ficarão subitamente muito quentes. Tente resolvê-lo com amortecedores e, possivelmente, adicionar termostato com vários sensores. A desvantagem de um ecobee é que você precisa trocar as baterias periodicamente nos sensores remotos. A tekmar faz algumas versões de fios, mas é necessário passar um fio para cada sensor. Trocar baterias em uma única casa não é um problema, mas em um aluguel se torna problemático.
Não há muito mais no caminho de uma solução simples que você possa fazer e que eu saiba.
Nota
Na minha região, moradias com várias unidades exigem separação por fogo entre todos os apartamentos. Se um sistema de dutos for usado, os amortecedores de incêndio precisam ser instalados em todas as barreiras de incêndio. Não sei se isso se aplica a você, mas tenha cuidado ao lidar com várias casas de habitação.