Ele não é de plástico. Depois que o Doctor voou o Pandorica para o Sun / TARDIS que reiniciou o universo. Então, isso restaurou Rory a ser humano. No entanto, devido a ... timey-wimey, ele, Amy, River e o Doctor ainda se lembram do TARDIS explodindo e terminando o universo, junto com a espera de 2000 anos.
Como ele é humano, acho que todos nós entendemos como ele foi pai de uma criança.