Existem algumas teorias por aí e você está certo de que a capacidade de remover o parasita também deveria ter desaparecido. Se você se lembra de quando ela remove o parasita, ela libera energia suficiente para quebrar o vidro atrás dela. Pode ser que ela tenha atingido seu limite ou que tenha esgotado o poder e que ele precise ser reabastecido. Há também a teoria de que seus poderes estão diretamente ligados ao leitor da mente e ao contrário, com o portão agora fechado novamente (pelo menos em Hawkins), pode ser que ela não tenha mais as habilidades.
Seus poderes também estão diretamente ligados às suas emoções, a perda de Hopper e o uso delas muito podem tê-la desgastado completamente e eles ficam adormecidos até que ela realmente precise deles.