Já foi dito:
Better safe than sorry. You haven't measured the absolute sugar or acidity levels. Freezing it will do no harm. – SAJ14SAJ Jan 29 at 1:47
Eu definitivamente não sou um especialista em panificação, mas trabalhei com frutas em outros contextos. A única vez que eu estaria preocupado com o congelamento seria se eu adicionasse óleo, como para uma marinada ou algo parecido. Em seu contexto, acho que o congelamento é bom, e parece que seria uma maneira conveniente de fazer lotes maiores para reutilização ao longo do ano.
PS: Esse purê parece ótimo, eu posso ter que tentar marinar algumas costeletas de frango ou porco!