No universo, este parece ter sido um pequeno erro da parte de um descontente e irritado Reg Barclay.
Observe que, de acordo com a (considerada canônica) a Enciclopédia Star Trek , existe algo como um capacitor de fluxo no Trek-verse. Foi mencionado em um episódio da Voyager como uma piada interna relacionada aos filmes do BTTF:
Flux Capacitance: A measurable physical property of energy flow. ("Prototype" (VGR)). This is a tip-of-the-hat reference to the flux capacitor, the key component in the time-traveling DeLorean automobile from Universal's Back to the Future movies.
É provável que Reg tenha falado um e dito o outro.
Fora do universo, a linha é bastante clara no script original do programa
HOLO-TROI: What do you wish you had said?
BARCLAY: I should have told him to mind his own damned business... I knew about the flow capacitor... I didn't need to hear about it from a seventeen year old kid.
Se eu tivesse que adivinhar, eu imaginaria que era simplesmente um deslize verbal do ator que passou despercebido pela equipe de filmagem.