O UTC é normalmente usado para coordenar planos de voo, controle de tráfego aéreo e assim por diante, para esta razão. O UTC é o horário "padrão" no sentido de que todos os outros fusos horários, incluindo aqueles ajustados à luz do dia, são definidos em relação a ele.
Naturalmente, o UTC não é normalmente usado no dia-a-dia pelo público, portanto, os horários nos horários, etc., ainda serão exibidos em horário local (horário de verão). Em seus exemplos, a única maneira inequívoca de expressar 2.29 quando ocorre "duas vezes" seria acrescentar o identificador de fuso horário (por exemplo, o Reino Unido usa GMT ou BST , dependendo da época do ano). Não é um problema com muita frequência!
Eu voei dos EUA para a Europa antes durante uma semana incompatível (os EUA se afastam do horário de verão uma semana antes da Europa). Não foi um problema; os horários locais foram ajustados de acordo com os bilhetes, website da companhia aérea, etc.