TL; DR Não, você não deve bloquear ou remover as aberturas. Eles servem a um propósito específico.
Como esta é uma área sem aquecimento, qualquer umidade que desça até lá permaneceria ali e causaria problemas. O crescimento do molde seria promovido, e também poderia rotular prematuramente a estrutura da sua casa. Haveria também um mau cheiro que seria muito difícil de se livrar.
Esta área ainda pode ser usada para armazenamento, apenas certifique-se de que o que estiver lá embaixo esteja protegido. Caixas de armazenamento de plástico são perfeitas para armazenar itens pequenos. Você também pode colocar alguns ganchos e prateleiras para outros itens. Uma coisa que você gostaria de evitar é armazenar qualquer coisa diretamente no chão de concreto. Você poderia colocar velhas paletas ou pedaços de madeira no chão. Você também quer ter certeza de que os roedores não podem entrar pelas aberturas. Você pode instalar um pedaço de tela de arame sobre eles no interior para evitar que eles entrem. Apenas certifique-se de que a malha seja strong o suficiente para evitar que ela a mastigue ou passe por ela.
Este espaço também seria uma perfeita adega de raiz. Existem alguns planos on-line aqui que lhe darão dicas sobre como fazê-lo. link