De acordo com as regras da Ryanair, você pode encontrar aqui, de fato, exigem que os não nacionais se apresentem no balcão para ter seus documentos de viagem verificados. Isso se aplica a você, pois o website deles não faz distinção entre cidadãos e residentes (confirmação por meio de atendimento ao cliente pendente)
6.4 All non-EU/EEA citizens must have their travel documents checked and stamped at the Ryanair Visa/Travel Document Check Desk before going through airport security.
Também note que já que eles não carimbarão seu passaporte, você precisará imprimir seu cartão de embarque, portanto, certifique-se de incluir mais tempo.
Se você já fez o check-in online, não há mais nada a fazer, a menos que queira deixar as malas e, nesse caso, você precisa ir até o balcão e esperar na fila. Caso contrário, você pode simplesmente ir direto para o portão, passando a segurança no caminho. Não há outros controles de imigração dentro da UE.
A maioria das companhias aéreas, incluindo a Ryanair, aceitam já um cartão de embarque electrónico ou móvel, pelo que nem sequer é necessário imprimi-lo.