A maior parte do filme live action se originou do primeiro filme de anime do GitS - eles pegaram o enredo principal do PuppetMaster e a sequência de cenas (pulando do prédio, os vários "fantoches", o mergulho submarino, a última luta envolvendo o tanque). Todos os personagens da Seção 9 e seus planos de fundo (com exceção de Killian / Kusanagi) são do primeiro filme (embora, o chefe tenha um nível ruim na ação ao vivo).
No entanto, alguns elementos dos filmes / séries posteriores também foram adicionados - as gueixas, por exemplo. Além disso, o principal antagonista combina elementos de várias fontes:
he hacks into people's minds like the PuppetMaster from the first movie, but is not an emergent AI. He is a cyborg with similar background to the Major, and incorporates elements of the Laughing Man.
Além disso, o plano de fundo de Kusanagi parece ser uma invenção para o novo filme.