Como o Ardra penetrou nos escudos da Enterprise tão facilmente?

Nada que o Ardra fez requer acesso aos sistemas Enterprise, e é consistente com o resto da série (s).

Yet all of the Federation's known enemies (including the Borg) seemed to follow the logical "penetrate/destroy shields or have them lowered" formula for forced entry. (I doubt a con-artist's starship has capability far exceeding the Federation's more famous enemies!)

A chave aqui é "ou tê-los abaixados". A Enterprise não tem seus escudos o tempo todo, e não tinha motivos para colocá-los em órbita de um planeta amigo. Ardra não tinha nenhum escudo impedindo-a de entrar e sair da Enterprise.

She also manages to disable core functioning aspects of the ship (transporter, communicators etc.)

Quando ela visita Picard em seus aposentos, ele é incapaz de usar as comunicações ou a porta. Isso é possível por meio de um campo de amortecimento localizado, provavelmente gerado por um dispositivo que foi transmitido com ela. E sua representação da "mulher perfeita" de Picard pode ser inferida pela forma como ele age, misturada com o conhecimento da história da Terra (que sabemos que ela tem por causa da forma que tomou durante o julgamento).

Por que eles não a detectaram entrando e saindo? Requisitos de energia. O navio não está continuamente procurando por tudo o tempo todo - é por isso que eles geralmente trazem um tricorder quando precisam detectar uma assinatura de transportador. No DS9, tratamos de instâncias adicionais, com Sloan entrando e saindo regularmente do DS9 sem detecção.

Mas, neste caso, a digitalização provavelmente não ajudaria muito. Em DS9 6x18, Inquisition , na primeira aparição de Sloan, ele de alguma forma conseguiu esconder sua assinatura de transportador - algo que um trapaceiro que confia em esconder seu uso da tecnologia com certeza saberia como fazer.

As necessidades da narrativa ditam as vulnerabilidades da empresa. Escudos são levantados ou abaixados quando esta ação aumenta a história, pois eles também se tornam substancialmente mais fracos quando a narrativa exige que isso ocorra para ameaçar a nave e sua tripulação.

No caso de Ardra, por que seu navio escapou da detecção por um período tão longo de tempo nunca é esclarecido. A tecnologia de camuflagem romulana e klingon é mostrada como uma função de uso intensivo de energia e, no entanto, a nave de Ardra era tão fraca que a Enterprise conseguiu mais tarde controlá-la sem muita dificuldade. Isso, é claro, nunca teria acontecido ao enfrentar um Warbird ou Bird of Prey (os navios de combate padrão Romulano e Klingon).

Além disso, há o erro gritante que Ardra é de alguma forma capaz de analisar a tecnologia incompatível com ela própria (neste caso, os sistemas da empresa) e alterá-los em minutos. Já que tanto a tecnologia Romulana quanto a Klingon são comparáveis às da Federação, e a tecnologia Cardassiana é apenas um pouco abaixo dela. Esses adversários deveriam logicamente ter sido capazes de fazer exatamente as mesmas coisas que Ardra em aproximadamente a mesma quantidade de tempo ou menos.

A penetração do escudo não é incomum. Outro exemplo específico da TNG que vem à mente é o gambito da Ensign Ro em "ataque preventivo", no qual ela é capaz de penetrar nos escudos da Enterprise D para distribuir suprimentos médicos. Como você diz, os borgs também são capazes de penetrar em escudos sem modulação de nutação constante.