Depende do que está na sua água, entre outras coisas - o último lugar que usei um amaciante, o ferro de água limpa fez o amaciante descarregar uma laranja muito enferrujada. Não é exatamente atraente para uma piscina.
Se você adicionar sal a uma piscina de água salgada que presumivelmente está perdendo água principalmente por evaporação, ela se tornará hiper-salina ao longo do tempo. Eu não tenho certeza de quanto isso seria considerado como um problema em uma piscina de água salgada - talvez você queira que seja como o mar morto - muito flutuante.
Mesmo que você não tenha ferro tornando a água de descarga enferrujada, o cálcio removido pelo amaciante se acumulará na piscina e poderá causar alguns problemas de qualidade da água.
No geral, parece mais provável que não seja uma má idéia, mas se você está determinado a ir em frente com isso, eu sugiro que você comece pegando um balde de água de descarga e deixe descansar por um alguns dias, para ver se isso lhe oferece algum insight sobre o que você obtém com sua água em particular.