Não, não pode ajudá-lo a escapar quando ingerido
As partes relevantes da magia Liberdade de movimento são citadas abaixo (PHB pg 244):
... spells and other magical effects can neither reduce the targets speed nor cause the target to be paralyzed or restrained.
Ser engolido não é nem um feitiço nem um efeito mágico, então este parágrafo não nos ajuda.
The target can also spend 5 feet of Movement to automatically escape from nonmagical restraints, such as Manacles or a creature that has it Grappled.
Grappled não é restrito, então isso não faria com que o PC fosse engolido. Se o seu Mestre fizesse uma leitura mais generosa daquela linha citada acima, então eles poderiam interpretar "restrições não-mágicas" para incluir qualquer coisa que lhe desse a condição Restringida, mas não era assim que eu a lia.
Supondo que você tenha usado o feitiço antes de ser engolido, você pode sair da garra inicial que permitia o Kraken engolir você, já que ele só pode engolir uma criatura que já havia agarrado. Do MM pg 197:
If the target is a Large or smaller creature grappled by the kraken, that creature is swallowed...