Nos livros, não há absolutamente nenhuma evidência de que o teto do Grande Salão "reaja ao mal". É simplesmente encantado para espelhar o céu real do lado de fora (um ponto que se repete ao longo da série); houve uma tempestade - totalmente desconectada de "Moody" (Barty Crouch Jr. usando a poção Polyjuice) - furiosa lá fora no primeiro dia do mandato no quarto ano de Harry.
Se reagisse ao mal, então teria feito todas as vezes que "Moody" entrasse , o que não era o caso. Ele também teria sido pego imediatamente, em vez de ser capaz de se passar por Moody (enganando até mesmo Dumbledore!) Por um ano inteiro.
No universo, foi essencialmente uma coincidência que a tempestade foi particularmente feroz naquele momento. Fora do universo foi usado para o efeito de aumentar a aparência feroz do personagem.Para leitura relacionada, eu abordou um tópico semelhante sobre o Science Fiction e o Fantasy Stack Exchange também.
No que diz respeito aos filmes, pode ser que eles quisessem sugerir que havia algo "errado" sobre o personagem, e decidiu que usar o teto era uma boa maneira de fazer isso. No entanto, desde o quarto filme foi feito mais tarde e presumivelmente o funcionamento do teto estava mais perto do que é descrito nos livros (ou ignorado inteiramente) nos filmes anteriores, isso acabou introduzindo uma inconsistência que não está presente nos livros. Tanto quanto eu sei, não há nenhuma explicação boa no universo - usando informações dos livros ou dos filmes - por que o teto não reagiria a Quirrell durante o primeiro ano de Harry se ele fosse encantado por reagir a pessoas "más" entrando no Grande Salão.