O samaritano não consegue detectar suas comunicações porque não sabe como estão falando - simplesmente não está preparado para ouvir essa frequência. No primeiro episódio da série 4, "Panopticon" , a equipe usa uma rede de antenas de TV VHF, que costumava pertencer para a Irmandade (gangue de Dominic); eles não estão usando Internet, satélites ou tecnologia celular - simplesmente, a rede que eles estão usando é ridiculamente simples e desatualizada, não é um lugar que o Samaritano olharia; Eu não tenho certeza se o samaritano sabe que isso pode ser feito (eu certamente não o fiz), e se isso acontecer - não pode ser usado porque não há nenhuma maneira física de fazê-lo, e provavelmente há criptografia.
O samaritano não pode atacar a Team Machine diretamente por causa da falha que eles introduziram no ponto culminante da terceira temporada, "Deus Ex Machina". Você pode ver a cena relevante aqui:
Em poucas palavras, eles não conseguiram impedir que o samaritano se tornasse operacional - então eles decidiram evitar que eles se direcionassem, codificando um protocolo para ignorar as identidades de 7 pessoas, então o samaritano não reconhece eles como Finch, Root, Shaw ou Reese (e os 3 hackers contratados pela Root).
Você pode realmente ver, na seqüência do título, como visto através dos olhos do Samaritano, que ele adquire os alvos por um segundo, mas é prontamente substituído por um "erro de classificação".
Isso não significa que o samaritano não esteja procurando por eles: simplesmente não pode usar as câmeras e toda essa tecnologia. Seus agentes estão constantemente procurando; na verdade, torna-se um ponto de trama que os quatro heróis não devem de forma alguma entrar em contato com suas identidades anteriores - Finch faz isso no episódio 10 da série 5, " O dia em que o mundo foi embora ", sem boas conseqüências.
Quando Root faz o mesmo, ela é reconhecida imediatamente: