Arsenal Mental só aplica o bônus para AC, e não para Reflexos.
Conforme você cita, o texto das regras chama explicitamente que se aplica a AC e, portanto, presumivelmente, não se aplica a mais nada. Isso é certamente incomum, mas eles a chamaram para que minha presunção fosse intencional.
Eu só posso especular por que exatamente isso foi feito um bônus de escudo, mas redigido como não seria empilhado se o monge da Alma de Ferro decidisse usar espada e tabuleiro ou então encontrar um item que desse um escudo bônus (embora esse bônus de outro escudo provavelmente forneça um bônus para o Reflex, o que o tornaria superior ao Arsenal Mental). Talvez tenha sido considerado poderoso demais para permitir que um monge da Alma de Ferro empunhasse uma arma de duas mãos e, ao mesmo tempo, tirasse o máximo proveito de um bônus comum de escudo, de modo que os projetistas a restringissem apenas a CA.