Dobby (provavelmente) o matou.
A menção final de Pettigrew no roteiro original (e no filme) é quando você o vê desmoronar, tendo sido atingido por trás por Dobby.
[The knob turns and light splashes into the cellar as ...... Wormtail fills the doorway]
[Harry and Ron stiffen, then watch Wormtail fall forward, stiff as a board, tumbling in a heavy heap on the cement floor below. They turn back as Dobby appears, Wormtail’s wand in his tiny fist.]
DOBBY: Who gets his wand?
Na falta de qualquer sugestão, acho que podemos dizer que é provável que Dobby o tenha matado.
Para apoiar isso eu ofereço em evidência o fato de que apenas alguns minutos depois de atirar Pettigrew nas costas, Dobby está mais do que feliz em tentar matar outro dos inimigos de Harry ( Bellatrix ) soltando um candelabro de três toneladas na cabeça. Ele claramente não tem escrúpulos em matar pessoas para proteger seu amigo Harry, apesar de seus fracos protestos de que ele só queria ferir ou mutilar.