Se disser que a chegada deve ser em até 90 dias, então sim, isso significa que tudo o que você precisa fazer é esperar até restarem 90 dias e aplicar.
Dito isto, a afirmação de que:
...you need to apply for an ETA beforehand
está errado se entrar por via aérea. No Aeroporto de Colombo, você pode arquivar o requerimento e obter o ETA antes de liberar a Imigração, apesar de custar US $ 40 em vez de 35.
Isso é confirmado pelo banco de dados usado pelas companhias aéreas, Timatic :
Passengers traveling as tourists must obtain an ETA on arrival, or before arrival at www.eta.gov.lk