Não. A ação Attack é uma ação específica que você toma em combate, que pode incluir vários ataques. Da página 71 das regras básicas do jogador:
Attack
The most common action to take in combat is the Attack action, whether you are swinging a sword, firing an arrow from a bow, or brawling with your fists. With this action, you make one melee or ranged attack. See the “Making an Attack” section for the rules that govern attacks. Certain features, such as the Extra Attack feature of the fighter, allow you to make more than one attack with this action.
A distinção importante para entender aqui é a diferença entre "a ação de ataque" e "um ataque". Flurry of Blows pode ser usado depois de você tomar a ação Attack, não depois de um ataque.
Então você toma a ação Attack, usando Extra Attack para atacar duas vezes, então você pode gastar um ponto de ki e usar sua ação bônus para atacar duas vezes com Flurry of Blows.Deve-se notar que, mesmo que Flurry of Blows possa ser usado após um ataque, e não após a ação Attack, ele ainda requer uma ação bônus e você só pode usar uma ação bônus por turno.