O SSR pode funcionar de forma independente e isso também é bastante comum. Os radares primários custam muito para manter e, à medida que mais e mais aviões são equipados com transponders, os radares primários estão sendo desligados. Muitas áreas agora têm cobertura secundária de radar, mas não há cobertura primária de radar.
O SSR depende apenas de respostas enviadas como resposta às suas próprias interrogações. Isso funciona bem em teoria, mas se torna um problema na prática em áreas onde muitas unidades SSR transmitem na mesma frequência, resultando em muitas respostas sobrepostas. Isso resulta em FRUIT e garbling .
Para áreas onde os dados primários e secundários do radar são usados, os dados são combinados para criar gráficos de radar individuais que são mostrados ao controlador. O controlador normalmente não precisa se preocupar com a fonte exata dos dados e não se preocupará em ligar ou desligar fontes individuais (pelo menos não durante as operações normais). As modernas unidades ATC recebem dados de radar de muitas fontes diferentes, incluindo estações SSR e PSR, e processam e combinam esses dados para uma única representação. Isso acontece usando tecnologias como ARTAS . Na tela de radar do controlador, os gráficos de aeronaves terão uma aparência diferente, dependendo de suas fontes de dados. Por exemplo, um alvo somente PSR pode ser mostrado como um círculo, um alvo somente SSR como um diamante e um alvo SSR + PSR como um quadrado. As especificações exatas variam de sistema para sistema.