O que aconteceu com os Engineers não é explicado claramente no filme, mas pode-se fazer especulações do que é realmente mostrado (eu gosto da expressão "black goo" para a substância :-):
- o holograma do Engineer correndo no corredor, o corpo do
um cortado pela escotilha
- o resultado de tentar reviver um Engenheiro (a cabeça solta): uma "explosão" biológica
- o resultado de um Humano parasitado pela "black goo snake": um monstro "morto-vivo" assassino
- o resultado de um Humano "envenenado" pela própria gosma negra: alguma forma de mutação de monstros também
- o resultado de uma mulher humana indiretamente contaminada pela gosma negra através da relação sexual: uma progênie monstro
Pode-se então supor que os Engenheiros criaram a gosma negra como uma arma biológica, com o objetivo de destruir a raça humana que eles inicialmente criaram. No entanto, seus experimentos de alguma forma saíram pela culatra e foram contaminados e destruídos (exceto aquele que entrou em stasis / cryo-sleep / whatever) ou talvez alguns também conseguiram escapar.
A "black goo snake" pode ser uma mutação de alguma forma de vida indígena ou que eles trouxeram com eles, um resultado da experimentação em alguma forma de "ratos de laboratório", ou um resultado da contaminação inicial do Engineer.
E "o" Alien (xenomorfo) como visto em "mais tarde" (filmado anteriormente) Alien filmes só é "nascido" do Engineer (é consumido entranhas, como em filmes Alien) que foi atacado e parasitado pelo monstro "nascida" de uma mulher humana (útero), ela mesma contaminada através de relações sexuais, etc ...