Talvez a citação da TARDIS deva ser interpretada como se tivesse sido:
I didn't always take you where you wanted to go, but I always took you where you needed to be!
No sentido de que ela não o leva para onde é melhor ele , mas onde é melhor para outros - em outras palavras, onde ele é mais necessário.
E é muito possível que, uma vez que não temos a imagem completa, como a TARDIS, não costumamos entender por que ele acabou em certos locais e como sua vinda para lá foi benéfica para qualquer um mas, mais uma vez, a TARDIS tem um conhecimento completo (ou quase completo) de todo o tempo e espaço.
Em particular, ela tem pleno conhecimento sobre a porção de tempo e espaço que é relevante para o médico.