Se a receita da sopa for eventualmente purê, então sim, você pode substituir com um pequeno problema.
Se a sopa é supostamente um pouco robusta, a substituição mudará um pouco a textura, mas o sabor provavelmente permanecerá o mesmo, e no final tudo deve ficar bem.
Note que isso pressupõe uma lata de tomates puré. Se o que você tem é concentrado de tomate (será marcado como 22 ou 28 Bx normalmente), então você não pode substituir diretamente, pois você precisa diluir.