Sempre que você mata um lich, seu corpo é destruído e se regenera ao lado de seu filactério.
Rejuvenation. If it has a phylactery, a destroyed lich gains a new body in 1d10 days, regaining all its hit points and becoming active again. The new body appears within 5 feet of the phylactery. (SRD V 5.1, p. 325 {italics mine}
Como isso acontece?
Sua alma voa para lá quando morre?
Eu estava lendo sobre bruxas, e notei que os bruxos da noite podem soltar uma bolsa da Alma, que pode prender almas malignas. Se eu conseguisse um, pensei que depois de destruir o corpo de um lich, poderia prender sua alma na bolsa enquanto caçava o filactério.
Sua alma não vai a lugar nenhum, já está no filactério. O filactério é um recipiente para a alma de um Lich.
Quanto ao corpo, é uma construção mágica, imagino que demore um pouco para o lich construir a energia necessária para se manifestar / convocar / criar? um novo navio capaz de resistir ao seu grande poder.
Da entrada Monster Manual no lich:
When a lich's body is broken by accident or assault, the will and mind of the lich drains from it, leaving only a lifeless corpse behind. Within days, a new body reforms next to the lich's phylactery, coalescing out of glowing smoke that issues from the device.
Essa é a extensão do RAW. Pode ajudar, no entanto, pensar no processo como semelhante a magic jar , salvo que não há limite para o seu alcance e o lich cria o seu próprio corpo em vez de roubar outro.