Para o visto de curta duração, o estado onde deve ser aplicado é o estado em que você passará mais tempo. Como isso não vai ficar na área de Schengen, isso muda para o país de entrada neste caso Alemanha .
No entanto, o visto de trânsito não se aplica a você e você precisará de um visto de visitante, já que está em trânsito por dois aeroportos na área de Schengen. Veja a nota importante sobre o item 2 do último parágrafo do trânsito aeroportuário .