Qualificador: moro no Japão e utilizei esses caixas eletrônicos milhares de vezes.
ATMs em bancos aqui (em geral não os de lojas de conveniência) aceitam depósitos em dinheiro. E em dinheiro eu não quero dizer que você coloca o dinheiro em um envelope e diz à máquina quanto está lá, quer dizer, você coloca o dinheiro na bandeja e a máquina conta e diz a você o quanto está lá.
Sim, é possível que o cliente B receba exatamente a mesma nota que o cliente A depositou 5 minutos antes.
O mesmo mecanismo é usado para depósitos e retiradas, então a razão para a grande caixa agora deve ser óbvia - ela é projetada em torno da necessidade de aceitar dinheiro em papel, não apenas dispensá-lo.
As máquinas aceitam (e dispensam) moedas também. É para isso que a caixa menor do lado esquerdo serve. Eles só aceitam até 200 moedas por vez, então esvaziar a bandeja não é tão conveniente quanto parece, mas é muito mais fácil do que rodar.