Nem todo mundo tem uma arma mágica
O tipo de saque e itens mágicos a serem distribuídos depende muito do GM. Enquanto sua campanha pode ter armas mágicas para todos os PCs, no meu geralmente apenas um personagem que regularmente usa ataques de armas tem armas mágicas no nível 5. É tempo de sobra para as resistências de danos não-mágicas se manifestarem. Mestres que são mais espertos que eu nesse sentido. É uma questão de mágica alta versus baixa no cenário da campanha e varia entre mesas e jogos.
Quando a equipe tem poucas armas mágicas, ou as armas mágicas não são confiáveis ou são mais fracas que suas contrapartes mundanas, as resistências do tipo de armas mundanas podem criar configurações de encontro interessantes onde alguns PCs são dramaticamente menos eficazes contra algumas criaturas do que outras. Isso pode causar boa variação para uma festa que está entediada com os encontros mais diretos.
Quero dizer, literalmente, não todos tem uma arma mágica
Assumindo que todo personagem experiente tem uma arma mágica, o que dizer dos exércitos não aventureiros das terras? Enquanto os líderes ou campeões de tais exércitos poderiam plausivelmente ter armas mágicas, eles geralmente são raros o suficiente para que nem todos os camponeses recrutados recebessem uma lança +1. Levando isso em conta, as resistências das armas mundanas servem a um propósito na ficção - elas são uma razão pela qual duzentos aldeões armados não podem compensar os aventureiros quando se trata de caçar criaturas com essas resistências.
Sabor
As origens de muitas das criaturas DnD com tais resistências possuem descrições da criatura tendo uma imunidade sobrenatural contra armas usuais, e inversamente sendo vulneráveis apenas a armas rituais específicas (ex. balas de prata ou estacas de madeira). Manter as resistências a danos é uma maneira da DnD homenagear as histórias originais das quais as criaturas mágicas se originam e fornece sabor, mesmo que a regra nunca seja esperada.