Quase certamente. A reprodução das diferentes fases produz uma à outra (facehuggers vêm dos ovos, as outras fases vêm da facehugger "infestation") então eu acho que por qualquer definição significativa eles teriam que ser a mesma espécie.
O motivo pelo qual não parece a princípio é que o facehugger morre em vez de se transformar no próximo estágio. Esta não é apenas uma larva normal para a metamorfose adulta. (O chestburster para transição "alienígena" seria uma metamorfose embora.)
O que parece estar acontecendo é a alternância de gerações (que é uma coisa real, mas principalmente uma coisa de planta na Terra - ). A reprodução da Forma A produz uma Forma B radicalmente diferente, que então produz a Forma A novamente.