Você pode pegar quantos arquétipos desejar, desde que eles não tenham efeito sobre a mesma habilidade. Todos os níveis que você toma (neste caso, para Magus) aplicam-se à classe e a todos os seus arquétipos.
A character can take more than one archetype and garner additional alternate class features, but none of the alternate class features can replace or alter the same class feature from the base class as another alternate class feature. For example, a fighter could not be both an armor master and a brawler, since both archetypes replace the weapon training 1 class feature with something different.
Como nota que me lembrou nos comentários. Você não pode multiclasse na mesma classe para ganhar outros arquétipos.