Sim.
Enquanto o polimorfo bane a forma polimórfica dos feitiços lançados, o texto da magia encontrar familiar indica que os familiares não lançam feitiços - eles somente os entregam.
Finally, when you Cast a Spell with a range of touch, your familiar can deliver the spell as if it had cast the spell.
Todos os familiares, polimorfos ou não, são apenas condutores para suas magias e não podem lançar feitiços. Como você não é polimorfo, ainda é possível conjurar uma mágica e entregá-lo através do seu familiar. Os animais que você pode ter como um familiar não podem conjurar magias para começar, de qualquer forma.
O limite de CR garante equilíbrio
Note que todas as criaturas que você pode ter como familiar são CR0, exceto a cobra venenosa no CR1 / 8. Isso significa que o número de criaturas em que você pode polimorfizar seu familiar é bastante limitado.
Uma explicação na ficção
Seu familiar é apenas um espírito que assume uma "forma familiar":
You gain the service of a familiar, a spirit that takes an animal form you choose...
Além disso, a reformulação da magia encontrar familiar permite que você altere sua forma:
Isso sugere que a forma física de um familiar, alvo de polimorfismo, não é tão importante quanto sua conexão com seu mestre - afinal, é apenas um espírito que pode assumir muitas formas mutáveis.If you cast this spell while you already have a familiar, you instead cause it to adopt a new form.