O visto só tem que ser válido quando você chega na zona Schengen, como qualquer visto.
Essa é uma pergunta muito comum e, na verdade, outras pessoas em outros fóruns têm até mesmo embaixadas enviadas por e-mail para confirmar e elas reconheceram que está tudo bem.
Se você realmente quiser ter certeza de que a companhia aérea está ok, ligue ou envie um e-mail para colocar sua mente em paz.